сполиготипирование

spoligotyping

[англ. sp(acer) — распорка, прокладка, oligo(nucleotide) — олигонуклеотид, от греч. oligos — немногочисленный, незначительный и греч. typos — отпечаток, форма, образец]

метод типирования микобактерий туберкулеза, основанный на анализе полиморфизма хромосомного локуса DR (англ. direct repeat — прямой повтор), который содержит варьирующее число коротких прямых повторов длиной 36 п.н., разделенных уникальными последовательностями (спейсерами) длиной от 34 до 41 п.н. (см. спейсер). Продукты ПЦР (см. полимеразная цепная реакция), проводимой с помощью праймеров, комплементарных прямым повторам, гибридизуют с набором синтетических олигонуклеотидов, ковалентно пришитых к нитроцеллюлозной мембране. Картина гибридизации служит характеристикой (сполиготипом) каждого штамма. Метод был предложен Дж. Камербеком с соавт. в 1996 г.